原本势力强盛的日莲宗，被天台宗灭了本院，再也压不过同样走底层路线的一向宗。只能退入商町在商人工匠中传播，苟延残喘。
而远走关东镰仓的净土宗，却是一家独大，渐渐成了关东第一宗派。
天台宗分出这三宗后，元气大伤。但宗派底子厚，与幕府交好，走亲善武家的上层路线。
平安二宗的另一支，真言宗。
虽然已经分裂成和歌山与高野山新旧两派，但旧派也吸收了南都的法相宗，控制了兴福寺为首的奈良古地。
平安二宗以及分支诸宗，深入参与世俗斗争，影响力越来越强。而南都六宗与禅宗三派越发式微，渐渐成了低调的吉祥物。
如今天下，九州，西国，四国等地，南蛮教的势力增长极快。
在近幾，一向宗盘踞石山，抵御南蛮教。南都被真言宗把持，对京都幕府最有影响力的是天台宗。